WooCommerce được phát triển đầu tiên bởi nhà phát triển chủ đề WordPress WooTheme,[3], người đã thuê Mike Jcar và James Koster, nhà phát triển tại Jigowatt, để làm việc trên một nhánh của Jigoshop [4][5] rồi tạo nên WooCommerce.[6] Vào tháng 8 năm 2014, WooCommerce đã được sử dụng bởi 381.187 trang web (tương đương với 17,77% các trang web thương mại điện tử trực tuyến).[7]

Vào tháng 11 năm 2014, WooConf đầu tiên, một hội nghị tập trung vào Thương mại điện tử sử dụng WooCommerce đã được tổ chức tại San Francisco, California. Nó thu hút 300 người tham dự.

Vào tháng 5 năm 2015, WooTheme và WooCommerce đã được mua lại bởi Automattic, nhà điều hành WordPress.com cũng là chủ quản của CMS WordPress.[8]